Samotná ves se v zápisech objevuje již od roku 1250.
Ve 14. století zde bylo vladycké sídlo a roku 1354 se uvádějí Adam, Filip, Bernard, Bohuněk a Oldřich bratři z Hlavatec jako patroni zdejšího kostela.
Část vesnice byla v držení vladyků z Vyhnanic a v 16. století byla
rozdělena na dvě části.
Jedna patřila k Bechyni a druhá k Želči.
Bechyňská část se připojila roku 1550 ke statku Bzí Volfu Hozlauerovi
z Hozlau.
Obě části vesnicese dostaly do majetku Petra Voka z Rožmberka.
Snad nejznámější rod hlavatecký, je po vladyku Ctiborovi, který dostal jméno "Roubík" a tohoto názvu užíval rod až do vymření roku 1530. Jindřich i Oldřich "Roubík" bojovali na straně krále Jiřího proti Rožmberkům.
V Hlavatcích se skrýval Žižka před Rožmberky u ženy Zdeníkové
a daroval jí snad pozlacený řetízek. Tak praví pověst.....

DALŠÍ INFORMACE: http://www.sobeslavsko.cz/obce_sobeslavska/hlavatce/hlavatce.htm